抗日战争接近尾声，中国胜利在望，日本部分残余势力还在垂死挣扎，情报员小美接到任务后，将和Jack一起去摧毁日军研发的生物细菌核心团队。途中遇到身份可疑的艳妮和组织派来的莫人，四人汇合后小美感觉到有些不对的地方，和Jack制造了假象确认了艳妮的间谍身份。和莫人将计就计，利用艳妮找到了日军细菌实验团队的真正藏身之处，在最后关头找到了日军投放细菌的地方，并将日军细菌核心团队和核心技术一举歼灭，消除了一场可怕的灾难。

7年前，一颗核弹将浣熊市的一切隐藏在历史之中。7年后的今天，美国中西部城市哈佛维尔，参议员朗•戴维斯因群众抗议其与威法玛公司的关系而被困飞机场。正当他乔装打扮准备离开之时，一位抗议者咬死了参议员的警卫。这位抗议者竟然是T病毒感染者！“浣熊市事件”幸存者， 克莱尔•雷德菲尔德在机缘巧合下救出议员，不想这时一架飞机冲向候机大厅。推开机门的，竟是一个个T病毒感染者！

里昂在执行从绑匪手中解救安东尼奥·泰勒博士的任务时，一个神秘女人挡住了他的任务。与此同时，克里斯正在调查旧金山爆发的僵尸事件，感染原因无法确定，唯一确定的是受害者最近都去过恶魔岛，根据这一线索，克里斯与他的团队前往这座小岛调查，那里有未知的恐怖在等待着他们。

T病毒在蜂巢中肆虐并很快打破了地面上浣熊市的平静，丧尸开始在人群中出现，安布雷拉公司将整个城市封锁，计划使用核武器摧毁城市以掩盖病毒外泄的事实。被安布雷拉注射T病毒使身体能力远超常人的爱丽丝（米拉·乔沃维奇 Milla Jovovich 饰）由昏睡中醒来，她在混乱的浣熊市与防卫队员瓦伦汀（Sienna Guillory 饰）、记者泰莉等人组成队伍，试图找到脱身之法。另一方面，安布雷拉公司的科学家艾肯佛博士为搭救被公司抛弃在城中的女儿安琪拉，以提供逃生方式为代价请求爱丽丝和防卫人员卡洛斯（Oded Fehr 饰）两组人马帮助。而安布雷拉公司派出了由环保分子麦特所改造成的“复仇邪神”阻止这一切…