影片背景设置在11世纪的波斯，一位英国人为了学习医术掩盖其天主教徒的身份，加入了伊斯巴罕一所只招收穆斯林和犹太人的医学院。他治随的老师名叫阿维森纳，是历史上著名的犹太科学家、思想家和医生。阿维森纳的著作达200多种，最著名的有《哲学、科学大全》，在当时是高水平的百科全书；另一部巨著是《医典》，直到17世纪西方国家还视为医学经典，至今仍有参考价值。《神医》结合史诗与虚构，展现了在那个被愚昧和迷信统治的世纪里一群人探索真知的无畏精神。

清末，沧州的乡下郎中喜来乐常常以奇招怪法治病救人，本与世无争，京城的靖王爷的格格得了重病被太医王天和宣布为绝症，靖王爷亲信鲁正明将喜来乐拉到京城为格格治病，喜来乐用裸体熏浴法将牙关紧闭、汤水不进的格格救活，赢得靖王爷称赞，但却引起王太医切齿的嫉恨，于是千方百计对喜来乐加以谋害。喜来乐本来就恋着在沧州开饭馆的情人，年轻漂亮的寡妇赛西施，更不愿在京城这是非之地与王太医纠缠，他几番谢绝靖王爷挽留美意，靖王爷和鲁正明用计终于将他留在京城，并把他设在沧州的“一笑堂”搬到京城来开业。在京城，喜来乐先是屡屡以偏方怪招儿疗治好各类病人的疑难杂症，令京城人大开眼界，赢得神医的美誉，后又进皇宫以妙方给珍妃瞧好了杖伤，得到皇上的赏识。这更叫嫉贤妒能的王太医寝食难安，他派人火烧了刚刚建好的“一笑堂”，听说喜来乐葬身火海，王天和不免又自我良心折磨，跪在菩萨面前忏悔。不料喜来乐阴差阳错的逃离了火场，王天和杀心愈切，屡屡在慈僖太后面前诬陷喜来乐，喜来乐不得不与王天和展开一番又一番的周旋较量，虽然他以自己独特的狡黠一次又一次地躲闪过王天和的暗算，但他仍苦恼不已，同是行医人，为什么如此苦苦相煎？

讲述了神医华佗行侠仗义、四处行医,以及他和一位公主之间的情感纠葛故事.

人世间，真正长生不老的，是亘古不变的真情 　　黑齿国；西南神秘之地。缇萦乃名医淳于意的女儿，因不好好学医，反而整天惹祸，被父亲罚到山中采药。时；大将军刘襄奉吕后命进攻黑齿国。被惊吓的缇萦巧遇前来盗取「不老药」的刘章，二人相遇后即展开一波波的事件。刘章出身贵族，表面上是吕后宠信的杀手，其实有他不为人知的计画。与哥哥刘襄和妹妹刘珊感情非常好。 　　是夜；莫娘入宫盗药，吕后震怒擒捕京城医生，淳于意入牢，缇萦心急救父，结识琴子。 　　刘章小时候无意中使得翁主琴子落入寒潭，造成终身痼疾，刘章在抱憾下对琴子的感情是亏欠，以致琴子误会对她有爱，是吕后利用的棋子来制造刘襄与刘章兄弟间的矛盾。 　　刘章依线索找到回春的莫娘，抢得「不老药」时；缇萦在琴子引荐面见吕后，一场激辩，吕后心服答应放人，因刘章已带回药，羁留医生已无必要。服了「不老」药的吕后果然青春貌美，为展现青春，宴邀文武百官。席间；吕后感觉身体不适，借故退席。原来「不老」药有时间限度，必须再服「长生」药，方可长生不老。吕后命刘章追找莫娘，夺取她身上的「长生」药，同时延请淳于意入宫，组成研究小组，在秘密基地研究长生不老药的秘方。 　　淳于意的无端失踪令缇萦忧急在心，四处打听寻人，此间大弟子骆凡与姊姊缇乐为霸占家产赶走缇萦。吕后服下长生不老药之后，性情大变，倒行逆施，为家天下，对刘氏施压。刘章深感刘襄对吕后唯命是从，助纣为虐，兄弟俩渐行渐远，终至反目。刘章在复国重任与兄弟情间双重夹击下与无家可归的缇萦周游列国由相知、相惜、相恋。 　　项云；西楚霸王项羽的后裔，在一次误以为死亡之下为缇萦医术所救，因之爱上缇萦。另；琴子不甘刘章离她而去，一路追赶而来，四人陷入感情漩涡。项刘不两立，缇萦为化消项羽后裔与刘家的恩怨牺牲，怀着感恩与痛苦的心境，背着成为活死人的缇萦历尽艰难，往巴蜀找到长生不死的扁鹊，以起死回生，救活缇萦。（其实乃淳于意假扮）直到查出父亲暗中为吕后制造「长生不老」药，忍痛与父亲决裂，联手刘章毁掉父亲心血。长生不老药的后遗症是缩短寿命，一如昙花，虽美但不长在，所以吕后心中的敌人是--时间，为「长生」与「不老」做批注。　　

医神保生大帝吴夲与瘟君成了同门师兄，千年斗法。天庭如人间，小人当道，君子被贬，落在下风的瘟君设计挑拨众神仙向玉帝告状，说保生大帝管了太多人间闲事，玉帝发怒将保生大帝打入凡间，并下旨交代一项“不可能的任务”，把一个品行顽劣的医官培养成一代名医，重返天界，恢复神籍。从此，医神变为郎中，混混成了徒弟，一对神差万里的师徒开始行走江湖，医疗众生。

继2003年播出的电视剧《神医喜来乐》成就经典的十年之后，原班主创再续前缘的新篇新传。作品照应前部并呈现新的风格，在拍摄制作和视觉观感上更加精良化。故事自庚子国变再度拉开，被发配东北的神医喜来乐一家又被卷入更加动荡的时代漩涡。

吴夲原是一个掌管医书的小神，却凭借智慧和魄力多次阻止神医盖飞和魔王瘟君袭击天庭。在一次与盖飞和瘟君的打斗中，三人纷纷落入凡间。玉帝的两位女儿也因卷入争斗而误落凡间。在凡间，吴夲成了游医行侠仗义，治病救人，受百姓爱戴，引来已是太医的盖飞嫉妒。两人在凡间争斗不断。误落凡间的两位公主对吴夲心生爱慕，却又深陷二人的争斗，与此同时，瘟君之徒青竹欺骗下凡寻找公主的哪吒，寻找到复原瘟君的宝贝，使得魔王再次...

张振东穷困潦倒家徒四壁，爷爷去世后，常被村长的儿子白三欺凌，偶然获得一本奇书《不求人》。小试身手后，张振东成了村里小有名气的医生。与此同时恶势力正在酝酿着一场大阴谋。张振东和刘月香相遇，两人开始了逃亡之旅。路上两人一路躲避绑匪。回城路上，再遇绑匪。下乡旅游的网红女主播晶晶缠着张振东要拜他为师，跟着张振东和刘月香进了城。不速之客突然到来，张振东这才恍然明白一路过来阴谋重重。

苏念，原本是一名医生，遭到同父异母妹妹苏烟的谋害后，穿越到古代成为了苏国公府不受宠的嫡女，同时也是离王妃，一个遭家族利用，被太后用作监视离王的棋子。原主在离王府中经历了被下药、被误会、被囚禁等一系列苦难，最终在一次被迫打胎中死亡，而医生苏念则在此时穿越而来。穿越后的苏念，决心保护原主的孩子，并为原主伸张正义。她利用自己的现代医术，以“毒医圣手”的身份在大隋国积累了声望，攒到了自己的小金库，甚至离王也秘密寻找她来治疗自己的腿疾。苏念的复仇之路充满曲折，她不仅要对付苏嫣然母女，还要处理与离王的关系。

新皇登基立后，西宁国最尊贵的公主惨死当殿，重生一世，她不再做他的王妃，她要改嫁！王妃重生，手撕渣男，脚踩贱女，一路复仇改命，顺便捡个痴心汉，爽感频出，甜宠不断。

一段神医的传奇，一生爱恨的纠葛，且看陈肖书写属于他的传奇故事

李阳的父亲因被诱赌石而倾家荡产，最终跳楼自杀。李阳成为周家的上门女婿，在婚礼上遭到表哥李江龙的讽刺，李江龙甚至诋毁周雪，李阳愤怒但被母亲劝阻。李阳起初误会周雪从事不正当工作，但其实周雪是总裁，她要求李阳配合自己，承诺给予好处。李阳在婚礼后得到家族戒指，获得透视和医术能力。他利用透视能力在赌石场击败李江龙，获得鉴宝大佬钱老的认可。在周雪公司筹办的拍卖会上，李阳再次展现透视能力，赢得宝物，而李江龙买到假货。李阳买下假货，发现其中藏有至宝，李江龙因此怀恨在心还放下狠话。钱老因李江龙的狠话晕倒，李阳用医术救醒他，赢得周雪的好感。周雪提出条件，若李阳赢得药王比赛，她将全心全意对他。李阳答应，并在医院工作时展现医术，赢得院长和同事的尊重。

顾云儿因遭追杀意外穿越成古代的凌湘君。她惊讶地发现，凌湘君的相识慕云止与她初恋叶沐辰外貌一致。心存对叶沐辰的愧疚与怀念，顾云儿把对初恋的感情转移到慕云止身上，深陷痴情之中。即使慕云止对她百般刁难，她亦不曾放弃，始终以满腔热情和坚持回应着慕云止的冷漠与试探，展现出自己对这段感情坚定不移的决心。

因为医院的一场医闹事故，苏清欢穿越到了古代。穿越三年一直在山村的苏清欢因为强行婚配要被嫁给屠夫，逃跑路上想到买一个夫婿回家的办法以摆脱强行婚嫁。却不料买到了大晋战神陆弃。起初陆弃并不相信苏清欢并且起了杀心，而苏清欢见男人死不了便打算将他治好。陆弃苏清欢回到苏家被嫌弃刁难，陆弃出手教训屠夫。晚间休息时被苏家人泼油烧屋，苏清欢借此要得100两银子，教训了苏家人一顿。镇南王将苏清欢请去治病，却因她样貌丑陋被羞辱，苏清欢凭借自己在现代学习的医术治好了镇南王世子却被关押，陆弃为了救苏清欢主动暴露身份。苏清欢造出肥皂，在当地热卖。两人的感情也在经历的事情中越来越深，凭借着自己的智慧化解了一次又一次危机。苏清欢也知道了陆弃的真实身份，两人大婚。

神医携三宝归，复仇虐渣，与总裁共谱情缘。

无父无母的孤儿李阳被三位师娘收养在潜龙山学医学武，成年后奉师娘之命下山寻找未婚妻苏小雨，哪成想一下山就遇到了改名苏清雨的未婚妻，二人的命运无形中纠缠在了一起。随后李阳因寻找苏小雨战血堂、斗庸医、展医术，最终成为名震江州市的大人物并抱得美人归。

中医世家之女唐杞子偶然间救下了被困画中的唐代神医，因从小佩戴的祖传手镯与其玉佩连接，俩人被困在了一丈之内，从此开启了亲密的同居生活。在努力适应现代生活的过程中，神医唐勤简也身体力行地教会了唐杞子如何成为一名优秀的中医。

南宫家的三小姐，南宫浅从小就体弱多病，胆小怕事，脑子也愚笨，娘亲去世后被同父异母的两个姐姐排挤和欺凌，被称之为废材。一次偶然的机会，南宫浅从爹手中得到了传家之宝神农神戒，打开了穿越的大门，来到了仙界修炼。从此以后，南宫浅脱胎换骨，身怀神功附体，再也没人敢欺负她。强大后的南宫浅不满意家族给她安排与太子的婚事，屡次当众顶撞太子。一次偶然南宫浅遇到受伤的七皇子，渐渐爱上了风流倜傥的七皇子，从此太子与七皇子的恩怨不断，开启了爱情的保卫战。

战国时期，一场变故让郑国公主半夏沦为孤儿。她流落民间，结识神医苍术的两个徒弟狗宝和独活，以及巫医葛根的女儿丁香。四个人青梅竹马，一起长大。半夏的恋人独活医术高超，但贪恋荣华，背信弃义。半夏逐渐发现狗宝才是她一生所爱。狗宝出身卑贱，擅出奇招看病，一生理想只在悬壶济世。可命运一次又一次把他拖入危机中。狗宝坚守正义，固守医道，在丁香、葛根、半夏以及几个徒弟的帮助下，潜心研修医术，用神奇的医术多次挫败独活的阴谋。独活多行不义必自毙。狗宝最终也实现人生理想，远离恩怨是非，带着恋人丁香游历民间，终生为百姓治病，救治百姓不计其数，被后世百姓尊为神医。